RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.52■□□□□ 0.39
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RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRB2O60241 1585 aa17.5■□□□□ 0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.5■□□□□ 0.39
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RABGEF1-209ENST00000607882 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.36■□□□□ 0.37
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RABGEF1-209ENST00000607882 TMF1P82094 1093 aa17.34■□□□□ 0.37
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RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SOCS7O14512 581 aa17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GCP02774 474 aa17.33■□□□□ 0.36
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RABGEF1-209ENST00000607882 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa17.31■□□□□ 0.36
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RABGEF1-209ENST00000607882 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.3■□□□□ 0.36
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RABGEF1-209ENST00000607882 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.2■□□□□ 0.34
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RABGEF1-209ENST00000607882 NRKQ7Z2Y5 1582 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FYB1O15117 783 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 AKAP12Q02952 1782 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PANK3Q9H999 370 aa17.19■□□□□ 0.34
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