RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGS3P49796 1198 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DLC1Q96QB1 1528 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MED14O60244 1454 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHDP01880 384 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.06■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RLBP1P12271 317 aa28.05■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.05■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNRQ92752 1358 aa28.05■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRB2O60241 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.04■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLKQ9UBT6 870 aa28.03■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.03■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIPK4P57078 832 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NME9Q86XW9 330 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.01■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.01■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP7BP35670 1465 aa28■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.98■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.96■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.96■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMOX1P09601 288 aa27.96■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRKAR2BP31323 418 aa27.96■■■□□ 2.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM161AQ3B820 660 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C8orf34Q49A92 452 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.93■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.93■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM2FA1L443 756 aa27.92■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FCHSD2O94868 740 aa27.92■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.92■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.91■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LTKP29376 864 aa27.91■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.9■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.9■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COG3Q96JB2 828 aa27.89■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.88■■■□□ 2.05
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TECPR2O15040 1411 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIRT1Q96EB6 747 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPS1P31327 1500 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL16Q14005 1332 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL13P35225 146 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM27P14373 513 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NFE2L2Q16236 605 aa27.8■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.79■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AAMPQ13685 434 aa27.79■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A3P48751 1232 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACEP12821 1306 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EID1Q9Y6B2 187 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL27Q8NEV9 243 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOX12O15370 315 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.73■■■□□ 2.03
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