RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC61Q9Y6R9 512 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MS4A1P11836 297 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEUROD2Q15784 382 aa31.43■■■□□ 2.62
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCP11L2Q8N4U5 519 aa31.41■■■□□ 2.62
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BACH2Q9BYV9 841 aa31.39■■■□□ 2.62
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADGRB2O60241 1585 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NME9Q86XW9 330 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MON2Q7Z3U7 1717 aa31.33■■■□□ 2.61
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITSN1Q15811 1721 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DIP2AQ14689 1571 aa31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP12Q02952 1782 aa31.31■■■□□ 2.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.29■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTCH1Q13635 1447 aa31.28■■■□□ 2.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.25■■■□□ 2.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHF1Q96S99 279 aa31.24■■■□□ 2.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.22■■■□□ 2.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.22■■■□□ 2.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCAR3O75815 825 aa31.17■■■□□ 2.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP6P35125 1406 aa31.14■■■□□ 2.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.14■■■□□ 2.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RSPH6AQ9H0K4 717 aa31.08■■■□□ 2.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMOX1P09601 288 aa31.08■■■□□ 2.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL13P35225 146 aa31.08■■■□□ 2.57
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.06■■■□□ 2.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSH2Q76I76 1423 aa31.03■■■□□ 2.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOX12O15370 315 aa31■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.99■■■□□ 2.55
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