RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	A2M	P01023	1474 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	AGL	P35573	1532 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	IRF6	O14896	467 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	ITGAE	P38570	1179 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	HR	O43593	1189 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	TATDN2	Q93075	761 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	OAT	P04181	439 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NUMB-231	ENST00000559312	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	STAC3	Q96MF2	364 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	EYA1	Q99502	592 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	NAIP	Q13075	1403 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	SMAP	O00193	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	AK7	Q96M32	723 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	KIF3B	O15066	747 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NUMB-231	ENST00000559312	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	GGT6	Q6P531	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	UNC13B	O14795	1591 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	KANK1	Q14678	1352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	DNAJB2	P25686	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	MLEC	Q14165	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM66	O15016	1216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	HRC	P23327	699 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NUMB-231	ENST00000559312	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	AMHR2	Q16671	573 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC3	O15438	1527 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	NUP155	O75694	1391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	CEP152	O94986	1710 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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