RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.32■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.32■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.32■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 ADGRB2O60241 1585 aa27.28■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 RIPK4P57078 832 aa27.27■■□□□ 1.96
TMEM260-216ENST00000557657 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.27■■□□□ 1.96
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TMEM260-216ENST00000557657 SEC24BO95487 1268 aa27.24■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.23■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 POLKQ9UBT6 870 aa27.23■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 HMOX1P09601 288 aa27.23■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.23■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.22■■□□□ 1.95
TMEM260-216ENST00000557657 NME9Q86XW9 330 aa27.21■■□□□ 1.95
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TMEM260-216ENST00000557657 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.17■■□□□ 1.94
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TMEM260-216ENST00000557657 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.14■■□□□ 1.94
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TMEM260-216ENST00000557657 USP19O94966 1318 aa27.14■■□□□ 1.94
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TMEM260-216ENST00000557657 IL13P35225 146 aa27.04■■□□□ 1.92
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TMEM260-216ENST00000557657 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM260-216ENST00000557657 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM260-216ENST00000557657 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 MBIPQ9NS73 344 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 VAMP4O75379 141 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.93■■□□□ 1.9
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