RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544057.1

PHOX2A-202, Transcript of paired like homeobox 2A, humanhuman

TSL 3

Gene PHOX2A, Length 605 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2A-202ENST00000544057 TMC1Q8TDI8 760 aa41.12■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 C8orf37Q96NL8 207 aa41.12■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 NINLQ9Y2I6 1382 aa41.12■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 USP6P35125 1406 aa41.11■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 NGLY1Q96IV0 654 aa41.1■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 ABTB2Q8N961 1025 aa41.08■■■■■ 4.17
PHOX2A-202ENST00000544057 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.06■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.06■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 AKAP12Q02952 1782 aa41.06■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 AFF2P51816 1311 aa41.05■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa41.04■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 PLEKHG5O94827 1062 aa41.02■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 NLRP13Q86W25 1043 aa41.01■■■■■ 4.16
PHOX2A-202ENST00000544057 SSH2Q76I76 1423 aa41.01■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.99■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCA3Q99758 1704 aa40.99■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.97■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 POTEAQ6S8J7 498 aa40.96■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 NUTM2GQ5VZR2 741 aa40.95■■■■■ 4.15
PHOX2A-202ENST00000544057 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.94■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.94■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 USP21Q9UK80 565 aa40.93■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 NLRP6P59044 892 aa40.92■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 ILDR2Q71H61 639 aa40.92■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.91■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 USP19O94966 1318 aa40.9■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 A0A1W2PP64 1363 aa40.89■■■■■ 4.14
PHOX2A-202ENST00000544057 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.86■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.86■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 FAM83GA6ND36 823 aa40.84■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 SLIT2O94813 1529 aa40.83■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 PIK3C2AO00443 1686 aa40.83■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 GCP02774 474 aa40.82■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 RXRBP28702 533 aa40.82■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.82■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.82■■■■■ 4.13
PHOX2A-202ENST00000544057 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.81■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.79■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.78■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 KIAA0232Q92628 1395 aa40.77■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 USP31Q70CQ4 1352 aa40.76■■■■■ 4.12
PHOX2A-202ENST00000544057 CPDO75976 1380 aa40.75■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.75■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 SLIT3O75094 1523 aa40.75■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.74■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 ATRNO75882 1429 aa40.74■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 NME9Q86XW9 330 aa40.72■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 BTG4Q9NY30 223 aa40.72■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 MYOM1P52179 1685 aa40.7■■■■■ 4.11
PHOX2A-202ENST00000544057 USP54Q70EL1 1684 aa40.68■■■■■ 4.1
PHOX2A-202ENST00000544057 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PHOX2A-202ENST00000544057 CHRNA2Q15822 529 aa40.66■■■■■ 4.1
PHOX2A-202ENST00000544057 VPS72Q15906 364 aa40.66■■■■■ 4.1
PHOX2A-202ENST00000544057 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PHOX2A-202ENST00000544057 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.63■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 COG3Q96JB2 828 aa40.61■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.59■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 NRAPQ86VF7 1730 aa40.59■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.59■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.59■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.58■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.58■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 SOX12O15370 315 aa40.57■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 EVA1CP58658 441 aa40.57■■■■■ 4.09
PHOX2A-202ENST00000544057 FYB1O15117 783 aa40.56■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.55■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 SOCS7O14512 581 aa40.55■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.55■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 NFAT5O94916 1531 aa40.54■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.54■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.53■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.51■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 PANK3Q9H999 370 aa40.51■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 STRN4Q9NRL3 753 aa40.51■■■■■ 4.08
PHOX2A-202ENST00000544057 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.5■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.48■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.48■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa40.47■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.47■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 GLI3P10071 1580 aa40.47■■■■■ 4.07
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCC6O95255 1503 aa40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms