RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP13Q86W25 1043 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 USP6P35125 1406 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 ABTB2Q8N961 1025 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-208ENST00000504294 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-208ENST00000504294 NGLY1Q96IV0 654 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 SSH2Q76I76 1423 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS2O95450 1211 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 ALS2Q96Q42 1657 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PP64 1363 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf37Q96NL8 207 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-208ENST00000504294 LRP6O75581 1613 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 AKAP12Q02952 1782 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 USP19O94966 1318 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.05■□□□□ 0.8
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SH3BP2-208ENST00000504294 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 USP31Q70CQ4 1352 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 AFF2P51816 1311 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHG5O94827 1062 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 COG3Q96JB2 828 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 USP21Q9UK80 565 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-208ENST00000504294 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 CPDO75976 1380 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF7Q2M1P5 1343 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 NME9Q86XW9 330 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM83GA6ND36 823 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 PANK3Q9H999 370 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC7Q96M83 1385 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 SLIT3O75094 1523 aa19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0232Q92628 1395 aa19.95■□□□□ 0.79
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SH3BP2-208ENST00000504294 PIK3C2AO00443 1686 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 SLIT2O94813 1529 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 EVA1CP58658 441 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 NSD2O96028 1365 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA3Q99758 1704 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 BTG4Q9NY30 223 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 MYOM1P52179 1685 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 USP54Q70EL1 1684 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS72Q15906 364 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.91■□□□□ 0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 BCL9LQ86UU0 1499 aa19.9■□□□□ 0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.89■□□□□ 0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC6O95255 1503 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 ATRNO75882 1429 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 SOX12O15370 315 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRNA2Q15822 529 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF24Q5T7B8 1368 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 AMPHP49418 695 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 NFAT5O94916 1531 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 MORC1Q86VD1 984 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 IP6K1Q92551 441 aa19.83■□□□□ 0.77
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