RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.02■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 USP6P35125 1406 aa28.01■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 AKAP12Q02952 1782 aa28.01■■■□□ 2.08
ARRDC1-211ENST00000495220 MYOM1P52179 1685 aa28.01■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 SHPRHQ149N8 1683 aa28.01■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 LRP6O75581 1613 aa28■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 A0A1W2PP64 1363 aa27.99■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.98■■■□□ 2.07
ARRDC1-211ENST00000495220 SSH2Q76I76 1423 aa27.98■■■□□ 2.07
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ARRDC1-211ENST00000495220 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.96■■■□□ 2.07
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ARRDC1-211ENST00000495220 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.92■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF10O15013 1369 aa27.92■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 PANK3Q9H999 370 aa27.91■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.9■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.9■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.89■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 ALS2Q96Q42 1657 aa27.89■■■□□ 2.06
ARRDC1-211ENST00000495220 ABTB2Q8N961 1025 aa27.88■■■□□ 2.05
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ARRDC1-211ENST00000495220 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.86■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 NLRP13Q86W25 1043 aa27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 AFF2P51816 1311 aa27.83■■■□□ 2.05
ARRDC1-211ENST00000495220 USP31Q70CQ4 1352 aa27.82■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 NLRP6P59044 892 aa27.81■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.8■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 PIK3C2AO00443 1686 aa27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 FYB1O15117 783 aa27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 NME9Q86XW9 330 aa27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 C8orf37Q96NL8 207 aa27.78■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 USP19O94966 1318 aa27.77■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.76■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 USP54Q70EL1 1684 aa27.75■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 NGLY1Q96IV0 654 aa27.74■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 COG3Q96JB2 828 aa27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 NSD2O96028 1365 aa27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 ADAMTS2O95450 1211 aa27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.72■■■□□ 2.03
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ARRDC1-211ENST00000495220 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.71■■■□□ 2.03
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ARRDC1-211ENST00000495220 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 SLIT3O75094 1523 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-211ENST00000495220 GCP02774 474 aa27.7■■■□□ 2.02
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ARRDC1-211ENST00000495220 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.7■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCA3Q99758 1704 aa27.67■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 PLEKHG5O94827 1062 aa27.66■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
ARRDC1-211ENST00000495220 USP21Q9UK80 565 aa27.63■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.63■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 CPDO75976 1380 aa27.62■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 NFAT5O94916 1531 aa27.6■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 MORC1Q86VD1 984 aa27.59■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.58■■■□□ 2.01
ARRDC1-211ENST00000495220 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.57■■■□□ 2
ARRDC1-211ENST00000495220 KIAA0232Q92628 1395 aa27.57■■■□□ 2
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM83GA6ND36 823 aa27.56■■■□□ 2
ARRDC1-211ENST00000495220 SOX12O15370 315 aa27.56■■■□□ 2
ARRDC1-211ENST00000495220 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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ARRDC1-211ENST00000495220 ATRNO75882 1429 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC6O95255 1503 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.49■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 FBLN1P23142 703 aa27.49■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 SLIT2O94813 1529 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 CHRNA2Q15822 529 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-211ENST00000495220 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.47■■□□□ 1.99
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