RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MYCBP2-209	ENST00000491491	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MYCBP2-209	ENST00000491491	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	ACE	P12821	1306 aa		32.51	■■■□□ 2.8
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	AFF2	P51816	1311 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491		A0A1W2PP64	1363 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	SOCS7	O14512	581 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MYCBP2-209	ENST00000491491	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	RALBP1	Q15311	655 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	USP21	Q9UK80	565 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	RXRB	P28702	533 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	USP6	P35125	1406 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MYCBP2-209	ENST00000491491	NSD2	O96028	1365 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	SLIT2	O94813	1529 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	ATRN	O75882	1429 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	FYB1	O15117	783 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MYCBP2-209	ENST00000491491	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.19	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	USP19	O94966	1318 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	NLRP6	P59044	892 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MYCBP2-209	ENST00000491491	GC	P02774	474 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	NME9	Q86XW9	330 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	RGS12	O14924	1447 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	VPS72	Q15906	364 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73

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