RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 GOLGA2Q08379 1002 aa28.73■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.73■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 RUNDC1Q96C34 613 aa28.72■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.71■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.71■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 FBLN1P23142 703 aa28.71■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 ACEP12821 1306 aa28.71■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 NGEFQ8N5V2 710 aa28.7■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.7■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.7■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 POLKQ9UBT6 870 aa28.68■■■□□ 2.18
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USP13-202ENST00000482333 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 SLFN5Q08AF3 891 aa28.67■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.67■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.66■■■□□ 2.18
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USP13-202ENST00000482333 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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USP13-202ENST00000482333 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 USP6P35125 1406 aa28.65■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.64■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 COG3Q96JB2 828 aa28.64■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.64■■■□□ 2.18
USP13-202ENST00000482333 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 WWC1Q8IX03 1113 aa28.63■■■□□ 2.17
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USP13-202ENST00000482333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.62■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.62■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.61■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.61■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 SSH2Q76I76 1423 aa28.6■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.6■■■□□ 2.17
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USP13-202ENST00000482333 NEUROD2Q15784 382 aa28.6■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.59■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.59■■■□□ 2.17
USP13-202ENST00000482333 E9PSI1 815 aa28.57■■■□□ 2.16
USP13-202ENST00000482333 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.56■■■□□ 2.16
USP13-202ENST00000482333 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.56■■■□□ 2.16
USP13-202ENST00000482333 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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USP13-202ENST00000482333 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.42■■■□□ 2.14
USP13-202ENST00000482333 PEAK1Q9H792 1746 aa28.41■■■□□ 2.14
USP13-202ENST00000482333 HMOX1P09601 288 aa28.41■■■□□ 2.14
USP13-202ENST00000482333 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.39■■■□□ 2.14
USP13-202ENST00000482333 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.37■■■□□ 2.13
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USP13-202ENST00000482333 RIPK4P57078 832 aa28.37■■■□□ 2.13
USP13-202ENST00000482333 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.37■■■□□ 2.13
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USP13-202ENST00000482333 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.36■■■□□ 2.13
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USP13-202ENST00000482333 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
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USP13-202ENST00000482333 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.33■■■□□ 2.13
USP13-202ENST00000482333 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.33■■■□□ 2.13
USP13-202ENST00000482333 USP54Q70EL1 1684 aa28.33■■■□□ 2.13
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USP13-202ENST00000482333 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.31■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 NEFMP07197 916 aa28.3■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.3■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 HSPA2P54652 639 aa28.3■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 NFE2L2Q16236 605 aa28.3■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 IL16Q14005 1332 aa28.28■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 ABTB2Q8N961 1025 aa28.28■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.28■■■□□ 2.12
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