RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.62■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.62■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 TSPOAP1O95153 1857 aa20.61■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.61■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.59■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.59■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.57■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.57■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.57■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 ATP7BP35670 1465 aa20.56■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 IL16Q14005 1332 aa20.56■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.54■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.54■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 MLECQ14165 292 aa20.54■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.53■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 RIPK4P57078 832 aa20.53■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 POLKQ9UBT6 870 aa20.52■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.883e-6■■□□□ 12.2
SHQ1-202ENST00000444040 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SHQ1-202ENST00000444040 FCHSD2O94868 740 aa20.51■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 USP35Q9P2H5 1018 aa20.5■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 FBLN1P23142 703 aa20.5■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.5■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 USP19O94966 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 METP08581 1390 aa20.5■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 SLC4A3P48751 1232 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 BCL11AQ9H165 835 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 NEFMP07197 916 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.49■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.48■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 ZMYM3Q14202 1370 aa20.48■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM27P14373 513 aa20.48■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.46■□□□□ 0.87
SHQ1-202ENST00000444040 SEC24BO95487 1268 aa20.45■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 PRKAR2BP31323 418 aa20.45■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.45■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 TECPR2O15040 1411 aa20.44■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.44■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 SIRT1Q96EB6 747 aa20.44■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 NME9Q86XW9 330 aa20.42■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.42■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.42■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.42■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.41■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.41■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 IL13P35225 146 aa20.41■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 NFE2L2Q16236 605 aa20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.4■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 KIF16BQ96L93 1317 aa20.39■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.39■□□□□ 0.86
SHQ1-202ENST00000444040 CPS1P31327 1500 aa20.39■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 HMOX1P09601 288 aa20.39■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.39■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.38■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.38■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 TNRQ92752 1358 aa20.37■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.37■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 NFKBIBQ15653 356 aa20.36■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF428Q96B54 188 aa20.36■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.36■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.36■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.35■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 COG3Q96JB2 828 aa20.35■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 C3P01024 1663 aa20.34■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 SMC5Q8IY18 1101 aa20.34■□□□□ 0.85
SHQ1-202ENST00000444040 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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