RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.12■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM27P14373 513 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPYL6Q8N831 410 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR63Q8IWG1 891 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC24BO95487 1268 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE3AQ14432 1141 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 BECN1Q14457 450 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3C2GO75747 1445 aa17.08■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.08■□□□□ 0.33
RABGEF1-210ENST00000437078 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE4CQ08493 712 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP152O94986 1710 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ABTB2Q8N961 1025 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 MADDQ8WXG6 1647 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXO3O43524 673 aa17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ACEP12821 1306 aa17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF521Q96K83 1311 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYM3Q14202 1370 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 LTKP29376 864 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 TET3O43151 1660 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB6Q5THR3 1501 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 FCHSD2O94868 740 aa17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 NFE2L2Q16236 605 aa17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 GNAI1P63096 354 aa17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 IL27Q8NEV9 243 aa17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 METP08581 1390 aa17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1-210ENST00000437078 PSME1Q06323 249 aa17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 F6X3S4 739 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf34Q49A92 452 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 MBIPQ9NS73 344 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA6Q8N139 1617 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF1BO60333 1816 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 NGEFQ8N5V2 710 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCC3O15438 1527 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 NFKBIBQ15653 356 aa17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 MLH3Q9UHC1 1453 aa17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC4A2P04920 1241 aa16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 ARID3AQ99856 593 aa16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 STK31Q9BXU1 1019 aa16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF16BQ96L93 1317 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 TNRQ92752 1358 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 HSCBQ8IWL3 235 aa16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 MYOM2P54296 1465 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNMO15061 1565 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 NEO1Q92859 1461 aa16.93■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA1P04083 346 aa16.93■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNA6P17658 529 aa16.93■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.93■□□□□ 0.3
RABGEF1-210ENST00000437078 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms