RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.41■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 A0A1W2PP64 1363 aa27.41■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 GLI2P10070 1586 aa27.4■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 SMC5Q8IY18 1101 aa27.4■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 LNPKQ9C0E8 428 aa27.4■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ELL3-201ENST00000319359 RIPK4P57078 832 aa27.38■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.38■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 HSCBQ8IWL3 235 aa27.36■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 NSD2O96028 1365 aa27.36■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 ASXL2Q76L83 1435 aa27.35■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 FBLN1P23142 703 aa27.33■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ELL3-201ENST00000319359 FYB1O15117 783 aa27.33■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 ABCC11Q96J66 1382 aa27.32■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 NUCB1Q02818 461 aa27.31■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.31■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.31■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.31■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.31■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.3■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 DDIT3P35638 169 aa27.28■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.28■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ELL3-201ENST00000319359 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.26■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 KIF16BQ96L93 1317 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 ABCC3O15438 1527 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 IL16Q14005 1332 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 KIF2CQ99661 725 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.24■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 IDI1Q13907 227 aa27.22■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.22■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 PRAM1Q96QH2 718 aa27.22■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.21■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.21■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 MRE11P49959 708 aa27.21■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.2■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.2■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa27.2■■□□□ 1.95
ELL3-201ENST00000319359 PRKAR2BP31323 418 aa27.2■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.2■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 TSPYL6Q8N831 410 aa27.2■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 SNX21Q969T3 373 aa27.19■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.18■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 HMOX1P09601 288 aa27.18■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.18■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 RAPGEF3O95398 923 aa27.17■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.17■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 ERBB4Q15303 1308 aa27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 CABP1Q9NZU7 370 aa27.16■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.15■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 CLCN1P35523 988 aa27.15■■□□□ 1.94
ELL3-201ENST00000319359 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.14■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.14■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.13■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 VAMP4O75379 141 aa27.12■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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ELL3-201ENST00000319359 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.11■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.11■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 PIK3C2BO00750 1634 aa27.11■■□□□ 1.93
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ELL3-201ENST00000319359 CDK19Q9BWU1 502 aa27.11■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.1■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 MED14O60244 1454 aa27.1■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.1■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 POLKQ9UBT6 870 aa27.09■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 SSFA2P28290 1259 aa27.09■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ELL3-201ENST00000319359 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
ELL3-201ENST00000319359 GBP4Q96PP9 640 aa27.07■■□□□ 1.92
ELL3-201ENST00000319359 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
ELL3-201ENST00000319359 GCC1Q96CN9 775 aa27.06■■□□□ 1.92
ELL3-201ENST00000319359 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ELL3-201ENST00000319359 MBIPQ9NS73 344 aa27.05■■□□□ 1.92
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