RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.84■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.84■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.83■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 METP08581 1390 aa24.82■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 IGHDP01880 384 aa24.81■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 RGS3P49796 1198 aa24.81■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.81■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.79■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 TNNQ9UQP3 1299 aa24.79■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 RLBP1P12271 317 aa24.78■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 FAM161AQ3B820 660 aa24.78■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.78■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 TNRQ92752 1358 aa24.77■■□□□ 1.56
USP21-201ENST00000289865 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 FBLN1P23142 703 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 C8orf34Q49A92 452 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 RIPK4P57078 832 aa24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 NBR1Q14596 966 aa24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 POLKQ9UBT6 870 aa24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.73■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 AAMPQ13685 434 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 IL16Q14005 1332 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 TECPR2O15040 1411 aa24.7■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 FCHSD2O94868 740 aa24.7■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
USP21-201ENST00000289865 CPS1P31327 1500 aa24.7■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 NME9Q86XW9 330 aa24.7■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.69■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.69■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.69■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.69■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.68■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 SIRT1Q96EB6 747 aa24.68■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.68■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.68■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 PRKAR2BP31323 418 aa24.67■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.67■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.67■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.66■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.66■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.64■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 AKAP12Q02952 1782 aa24.64■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 ITSN1Q15811 1721 aa24.64■■□□□ 1.54
USP21-201ENST00000289865 NEFMP07197 916 aa24.64■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 HMOX1P09601 288 aa24.63■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.62■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 COG3Q96JB2 828 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 TRIM27P14373 513 aa24.6■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 IL13P35225 146 aa24.6■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 C3P01024 1663 aa24.6■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.59■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 NFE2L2Q16236 605 aa24.59■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
USP21-201ENST00000289865 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.57■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 LTKP29376 864 aa24.56■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.56■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.56■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.55■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 KIF16BQ96L93 1317 aa24.53■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.53■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.52■■□□□ 1.52
USP21-201ENST00000289865 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.51■■□□□ 1.51
USP21-201ENST00000289865 SLC4A3P48751 1232 aa24.51■■□□□ 1.51
USP21-201ENST00000289865 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.5■■□□□ 1.51
USP21-201ENST00000289865 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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