RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262982.2

CSE1L-201, Transcript of chromosome segregation 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSE1L, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1L-201ENST00000262982 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CSE1L-201ENST00000262982 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.84□□□□□ -0.03
CSE1L-201ENST00000262982 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.83□□□□□ -0.03
CSE1L-201ENST00000262982 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.83□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.83□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.82□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.82□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.81□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 ATP7BP35670 1465 aa14.8□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 FBLN1P23142 703 aa14.79□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.79□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 AAMPQ13685 434 aa14.79□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 MLECQ14165 292 aa14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 METP08581 1390 aa14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 USP19O94966 1318 aa14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 POLKQ9UBT6 870 aa14.78□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.77□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 IL16Q14005 1332 aa14.77□□□□□ -0.04
CSE1L-201ENST00000262982 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.76□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.76□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 SLC4A3P48751 1232 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 RIPK4P57078 832 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 ZMYM3Q14202 1370 aa14.75□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 SEC24BO95487 1268 aa14.74□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 FCHSD2O94868 740 aa14.74□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.73□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.73□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 TRIM27P14373 513 aa14.73□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.73□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 CPS1P31327 1500 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 AKAP12Q02952 1782 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 TECPR2O15040 1411 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 BCL11AQ9H165 835 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.72□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 NME9Q86XW9 330 aa14.71□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.71□□□□□ -0.05
CSE1L-201ENST00000262982 PRKAR2BP31323 418 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 SIRT1Q96EB6 747 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 C3P01024 1663 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 NEFMP07197 916 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 IL13P35225 146 aa14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.69□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.68□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 USP35Q9P2H5 1018 aa14.68□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.68□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.67□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ITSN1Q15811 1721 aa14.67□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 HMOX1P09601 288 aa14.67□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 NFE2L2Q16236 605 aa14.67□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.67□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 TNRQ92752 1358 aa14.66□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.66□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CSE1L-201ENST00000262982 ZNF853P0CG23 659 aa14.64□□□□□ -0.07
CSE1L-201ENST00000262982 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.64□□□□□ -0.07
CSE1L-201ENST00000262982 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms