RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.72■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RIPK4P57078 832 aa24.72■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.72■■□□□ 1.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SEC24BO95487 1268 aa24.7■■□□□ 1.54
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LPCAT3-201ENST00000261407 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.69■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 MED14O60244 1454 aa24.69■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 NEFMP07197 916 aa24.69■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 POLKQ9UBT6 870 aa24.68■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.68■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.68■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.68■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.68■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.67■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.67■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 METP08581 1390 aa24.67■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 AGLP35573 1532 aa24.67■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.66■■□□□ 1.54
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LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.65■■□□□ 1.54
LPCAT3-201ENST00000261407 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.65■■□□□ 1.54
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LPCAT3-201ENST00000261407 HMOX1P09601 288 aa24.64■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 USP19O94966 1318 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 PRKAR2BP31323 418 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 NME9Q86XW9 330 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 REREQ9P2R6 1566 aa24.63■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.62■■□□□ 1.53
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LPCAT3-201ENST00000261407 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.61■■□□□ 1.53
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LPCAT3-201ENST00000261407 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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LPCAT3-201ENST00000261407 FCHSD2O94868 740 aa24.59■■□□□ 1.53
LPCAT3-201ENST00000261407 DLC1Q96QB1 1528 aa24.59■■□□□ 1.53
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LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.58■■□□□ 1.52
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LPCAT3-201ENST00000261407 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.56■■□□□ 1.52
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LPCAT3-201ENST00000261407 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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LPCAT3-201ENST00000261407 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
LPCAT3-201ENST00000261407 IL13P35225 146 aa24.52■■□□□ 1.52
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LPCAT3-201ENST00000261407 NFKBIBQ15653 356 aa24.5■■□□□ 1.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CPS1P31327 1500 aa24.5■■□□□ 1.51
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LPCAT3-201ENST00000261407 USP35Q9P2H5 1018 aa24.49■■□□□ 1.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.49■■□□□ 1.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.49■■□□□ 1.51
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LPCAT3-201ENST00000261407 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.46■■□□□ 1.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM83GA6ND36 823 aa24.45■■□□□ 1.5
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LPCAT3-201ENST00000261407 TNRQ92752 1358 aa24.43■■□□□ 1.5
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LPCAT3-201ENST00000261407 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF16BQ96L93 1317 aa24.42■■□□□ 1.5
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LPCAT3-201ENST00000261407 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.42■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 MBIPQ9NS73 344 aa24.42■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 LTKP29376 864 aa24.41■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.41■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LPCAT3-201ENST00000261407 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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