RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GCNT4Q9P109 453 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRCAMQ92823 1304 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF233A6NK53 670 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLDN3O15551 220 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXTL3O43909 919 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KPNA6O60684 536 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM20BO75063 409 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERLIN2O94905 339 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGRP01833 764 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCP2P22307 547 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNFSF9P41273 254 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCAR1P56945 870 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTENP60484 403 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP24A1Q07973 514 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP3CAQ08209 521 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTF1Q14872 753 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RABL3Q5HYI8 236 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFSD5Q6N075 450 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GJB7Q6PEY0 223 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GBP6Q6ZN66 633 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRAGAQ7L523 313 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 THNSL1Q8IYQ7 743 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC112Q8NEF3 446 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC51Q96ER9 411 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PANX2Q96RD6 677 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DESI2Q9BSY9 194 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.87□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A0B4J269 797 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC53A6NM62 1247 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP27XA6NNY8 438 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACKR2O00590 384 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPK13O15264 365 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 OGTO15294 1046 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 STX10O60499 249 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPAN1O60635 241 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR32O75388 356 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TOM1L1O75674 476 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOL4O94818 638 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASLP04424 464 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 IQCF3P0C7M6 154 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSPA6P17066 643 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNNI1P19237 187 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PON1P27169 355 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIK3CAP42336 1068 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIR2DL3P43628 341 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MXI1P50539 228 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBED6P86452 979 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 BIRC3Q13489 604 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMD6Q15008 389 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDXDC1Q6P996 788 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF180Q86T96 592 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF410Q86VK4 478 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM139Q8IV31 216 aa5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms