RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736		H3BQF6	201 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM63A	O94886	807 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	DNAJB1	P25685	340 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MAGEA4	P43358	317 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CLCN4	P51793	760 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	WASHC5	Q12768	1159 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SLC29A2	Q14542	456 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CROCCP2	Q86T23	111 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	NLRP14	Q86W24	1093 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	NETO2	Q8NC67	525 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PWWP2A	Q96N64	755 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736		E7EVH7	732 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	DFFA	O00273	331 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CA3	P07451	260 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TPSB2	P20231	275 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TACR2	P21452	398 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CCNC	P24863	283 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CDC25C	P30307	473 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	NDST2	P52849	883 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CDK16	Q00536	496 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SEMA5A	Q13591	1074 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TPSAB1	Q15661	275 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PARP6	Q2NL67	630 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	AFMID	Q63HM1	303 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	KCNK1	O00180	336 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ALOX15B	O15296	676 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	STC2	O76061	302 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	METTL18	O95568	372 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	OLFM2	O95897	454 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	APRT	P07741	180 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MYOG	P15173	224 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PTPN3	P26045	913 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GABRR2	P28476	465 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF844	Q08AG5	666 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF567	Q8N184	647 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MCU	Q8NE86	351 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736		E7ESA3	106 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GRM6	O15303	877 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	FGF19	O95750	216 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	LATS1	O95835	1130 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MYZAP	P0CAP1	466 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PFKL	P17858	780 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	MAPKAPK2	P49137	400 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CBLB	Q13191	982 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	SHH	Q15465	462 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	KYNU	Q16719	465 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	C5orf22	Q49AR2	442 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	PID1	Q7Z2X4	250 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	IGSF8	Q969P0	613 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	DPP7	Q9UHL4	492 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	RNF40	O75150	1001 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	CSPG5	O95196	566 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ACSL3	O95573	720 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ABHD2	P08910	425 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	HDC	P19113	662 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	HOXA9	P31269	272 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-227	ENST00000556736	ERVK-21	P61565	698 aa		18.66	■□□□□ 0.58

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