RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544800.1

CIT-215, Transcript of citron rho-interacting serine/threonine kinase, humanhuman

TSL 4

Gene CIT, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIT-215ENST00000544800 IRF1P10914 325 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 SDSP20132 328 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PROZP22891 400 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 ARSDP51689 593 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PPP2CBP62714 309 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PPP2CAP67775 309 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PRR20EP86478 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PRR20CP86479 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PRR20DP86480 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PRR20BP86481 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PRR20AP86496 221 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 RUNX1T1Q06455 604 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 ARID5BQ14865 1188 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 HECTD3Q5T447 861 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 SPATA1Q5VX52 437 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 TMEM215Q68D42 235 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 VSTM1Q6UX27 236 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 TBCKQ8TEA7 893 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 PKMYT1Q99640 499 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 LUZP4Q9P127 313 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CIT-215ENST00000544800 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 A0A1B0GUH1 482 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 A0A1W2PQM1 296 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 E7EWF7 191 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ABLIM1O14639 778 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 MID1O15344 667 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 AQP9O43315 295 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 DPM1O60762 260 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CXCL8P10145 99 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CCL4P13236 92 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 GOT1P17174 413 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ANXA13P27216 316 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 MYH10P35580 1976 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 LIFRP42702 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 MEOX1P50221 254 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 IST1P53990 364 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ADPRHP54922 357 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CDK18Q07002 472 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CST6Q15828 149 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.14□□□□□ -1.27
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CIT-215ENST00000544800 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 IQCKQ8N0W5 287 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 IFT74Q96LB3 600 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CALN1Q9BXU9 219 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CITO14578 2027 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CSF2P04141 144 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CYP21A2P08686 494 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 CLTAP09496 248 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 TAF6P49848 677 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 ABHD18Q0P651 414 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 PTK2BQ14289 1009 aa7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CIT-215ENST00000544800 SLC6A19Q695T7 634 aa7.13□□□□□ -1.27
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