RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MT-ND3P03897 115 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TPI1P60174 286 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA3BQ13214 749 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 HHATQ5VTY9 493 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF534Q76KX8 674 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CCT6BQ92526 530 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF558Q96NG5 402 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 WDCPQ9H6R7 721 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NMUR1Q9HB89 426 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MTRRQ9UBK8 725 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR27A2RRH5 827 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM72CH0Y354 149 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SUN1O94901 812 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FSBPO95073 299 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXN2P32314 431 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.921e-6■■■□□ 17.4
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PACSIN3-211ENST00000539589 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM72BQ86X60 149 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP93Q8N1F7 819 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MLNP12872 115 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC2P18074 760 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCR3P49682 368 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD5Q16401 504 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA21Q7Z572 469 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC6Q86X45 466 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 OSER1Q9NX31 292 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 C2CD2LO14523 706 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAM2O15394 837 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 APOEP02649 317 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SOD2P04179 222 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCHP24723 683 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP4Q13115 394 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC1A5Q15758 541 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TAC4Q86UU9 113 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 EPAS1Q99814 870 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 IL37Q9NZH6 218 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBBXA8MT70 800 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TM9SF1O15321 606 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 C1QAP02745 245 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1D2P34982 312 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PDK4Q16654 411 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP6Q2NL67 630 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PPM1NQ8N819 430 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BANPQ8N9N5 519 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 YME1L1Q96TA2 773 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQH9 124 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FGBP02675 491 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00271P0C7V0 271 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LGSNQ5TDP6 509 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BEND5Q7L4P6 421 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NETO2Q8NC67 525 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM169Q96HH4 297 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SCML2Q9UQR0 700 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT37O76014 449 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV3-25P01717 112 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LAG3P18627 525 aa20.78■□□□□ 0.92
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