RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513120.2

GPR78-206, Transcript of G protein-coupled receptor 78, human

TSL 2

Gene GPR78, Length 3,720 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPR78-206	ENST00000513120		A0A1B0GTW7	788 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	ARL4A	P40617	200 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	STT3A	P46977	705 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CA9	Q16790	459 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CRTAM	O95727	393 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NME3	Q13232	169 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	ITM2A	O43736	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CYP2C9	P11712	490 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CYP2F1	P24903	491 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SLC5A2	P31639	672 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SERPINB5	P36952	375 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NUDT2	P50583	147 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PKNOX1	P55347	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	KYAT1	Q16773	422 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PNPO	Q9NVS9	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NEMP1	O14524	444 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	RECQL4	O94761	1208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PTPN7	P35236	360 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	MLH1	P40692	756 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DGKD	Q16760	1214 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	JADE3	Q92613	823 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SIN3B	O75182	1162 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CYP3A5	P20815	502 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FLOT2	Q14254	428 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	GBE1	Q04446	702 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	STIL	Q15468	1287 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GPR78-206	ENST00000513120	EVPL	Q92817	2033 aa		11.96	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms