RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-206	ENST00000489977	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CYP1A2	P05177	515 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	IGFBP2	P18065	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	KCNJ4	P48050	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	POLE2	P56282	527 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PMPCA	Q10713	525 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	APOL1	O14791	398 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	NKX2-8	O15522	239 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PEPD	P12955	493 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	SLC5A1	P13866	664 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	IDE	P14735	1019 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	STT3A	P46977	705 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PRIM2	P49643	509 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	SELENOV	P59797	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CSHL1	Q14406	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	SHB	Q15464	509 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	IP6K1	Q92551	441 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF432	O94892	652 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ART1	P52961	327 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	FOXL2	P58012	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	GPR18	Q14330	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CADM3	Q8N126	398 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	FAR2	Q96K12	515 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	GRID2	O43424	1007 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	LCK	P06239	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PMS2	P54278	862 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	GRM4	Q14833	912 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	CDT1	Q9H211	546 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-206	ENST00000489977	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	CER1	O95813	267 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	GLUD1	P00367	558 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	KRT10	P13645	584 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	GLUD2	P49448	558 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	TAS2R50	P59544	299 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	GALNT3	Q14435	633 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	DUSP6	Q16828	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-206	ENST00000489977	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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