RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488687.5

PSME4-209, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSME4, Length 3,073 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-209ENST00000488687 HCAR3P49019 387 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SLC11A1P49279 550 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GPX6P59796 221 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CASC4Q6P4E1 433 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FUT10Q6P4F1 479 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PID1Q7Z2X4 250 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CYP4X1Q8N118 509 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CYTH2Q99418 400 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CEP41Q9BYV8 373 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RAD54BQ9Y620 910 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CLUHO75153 1309 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TNFRSF10BO14763 440 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 OPHN1O60890 802 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FAM107AO95990 144 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 INHBAP08476 426 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TPSB2P20231 275 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 STX2P32856 288 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PBX3P40426 434 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SERPINB4P48594 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GLUD2P49448 558 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GPR15P49685 360 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LRRC14Q15048 493 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TPSAB1Q15661 275 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BEND5Q7L4P6 421 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MON1AQ86VX9 555 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TDRPQ86YL5 185 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LRRC43Q8N309 656 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 STKLD1Q8NE28 680 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MCUQ8NE86 351 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GPR152Q8TDT2 470 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 C8orf48Q96LL4 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TRABDQ9H4I3 376 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.33□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 KCNK1O00180 336 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 DFFAO00273 331 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 IRAK2O43187 625 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LRIG2O94898 1065 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CREB1P16220 341 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 YWHAQP27348 245 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MAGEA9P43362 315 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 COG7P83436 770 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 IKBKEQ14164 716 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GPNMBQ14956 572 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GDAP1Q8TB36 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CASP10Q92851 521 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FBXO32Q969P5 355 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SERPINB11Q96P15 392 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PAFAH2Q99487 392 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TTPALQ9BTX7 342 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SENP1Q9P0U3 644 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SCML2Q9UQR0 700 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MTSS1O43312 755 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 SPAG7O75391 227 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 PAGE1O75459 146 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 NEBLO76041 1014 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 GALTP07902 379 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 FGFR3P22607 806 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 MAGEA11P43364 429 aa6.32□□□□□ -1.4
PSME4-209ENST00000488687 TLE2Q04725 743 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms