RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 TTC4O95801 387 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 OLFM2O95897 454 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SHBGP04278 402 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA31D3P0C874 917 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 RHOQP17081 205 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 PTPN3P26045 913 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CA8P35219 290 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ACTN2P35609 894 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 IRAK1P51617 712 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 UBE3AQ05086 875 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF33AQ06730 810 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 AP1B1Q10567 949 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SEMA5AQ13591 1074 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SLC29A2Q14542 456 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TAF12Q16514 161 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FAXCQ5TGI0 409 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 DENND2CQ68D51 928 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FBXL22Q6P050 247 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SPRED2Q7Z698 418 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ITIH5Q86UX2 942 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TMC8Q8IU68 726 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 LZTR1Q8N653 840 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CCNYQ8ND76 341 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 POF1BQ8WVV4 589 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 IGSF8Q969P0 613 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 PLD4Q96BZ4 506 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 RUFY1Q96T51 708 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC3Q9BY71 257 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ASB3Q9Y575 518 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ALPK3Q96L96 1907 aa9.8□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf78A6NCI8 922 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GRM6O15303 877 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MTSS1O43312 755 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MAP3K7O43318 606 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ACSL4O60488 711 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 GLUD1P00367 558 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 RB1P06400 928 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 C8AP07357 584 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MYOGP15173 224 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TPSB2P20231 275 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TACR2P21452 398 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FDFT1P37268 417 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MAGEA4P43358 317 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ARL4CP56559 192 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 COG7P83436 770 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CAMK1Q14012 370 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TPSAB1Q15661 275 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 HIF1AQ16665 826 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 KYNUQ16719 465 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 C5orf22Q49AR2 442 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MSS51Q4VC12 460 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ALFQ53S48 1182 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 TTMPQ5BVD1 217 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CENPUQ71F23 418 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CHSY1Q86X52 802 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF567Q8N184 647 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 MCUQ8NE86 351 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 EXOC4Q96A65 974 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 AZIN2Q96A70 460 aa9.79□□□□□ -0.84
SRPRB-202ENST00000466636 ARL8AQ96BM9 186 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms