RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCN3P51790 818 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP2Q05923 314 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DRP2Q13474 957 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTK2BQ14289 1009 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPNMBQ14956 572 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHHQ15465 462 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FYB2Q5VWT5 728 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO5Q75V66 913 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL13Q8N6R0 699 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STON2Q8WXE9 905 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO3102Q9H379 93 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ING3Q9NXR8 418 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GINS2Q9Y248 185 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PODXLO00592 558 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSTNO14793 375 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C22orf31O95567 290 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT11O96014 354 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VTNP04004 478 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMC5P62195 406 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREMQ03060 361 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BFSP2Q13515 415 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPECC1Q5M775 1068 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC13DQ70J99 1090 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF365Q70YC5 407 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM199Q8N511 208 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RDM1Q8NG50 284 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPPQ93052 612 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP28Q96RU2 1077 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLIN2Q99541 437 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLD4Q9HCU8 107 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EVPLQ92817 2033 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRM6O15303 877 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNA1P02708 482 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPH10BP0C881 870 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GHRP10912 638 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEOX1P50221 254 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC26A2P50443 739 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAM15Q13444 863 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BECN1Q14457 450 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF5Q15542 800 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XKR9Q5GH70 373 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAGE1Q8TC20 777 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM71BQ8TC56 605 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP170P1Q96L14 293 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL23AQ9NPF7 189 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RLIMQ9NVW2 624 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms