RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.5■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 KCNK1O00180 336 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 DFFAO00273 331 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN2P17706 415 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.5■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 GPR158Q5T848 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC31Q6UY01 552 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 ART4Q93070 314 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-204ENST00000452765 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.47■■□□□ 1.03
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SH3BP2-204ENST00000452765 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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SH3BP2-204ENST00000452765 CALCOCO2Q13137 446 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNC3Q14003 757 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC25Q86WR0 208 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 USP33Q8TEY7 942 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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