RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	IGSF8	Q969P0	613 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	HCN2	Q9UL51	889 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		15.08	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	PROB1	E7EW31	1015 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM23	O75077	832 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM253	P0C7T8	217 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	L1CAM	P32004	1257 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CD70	P32970	193 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	NHLH1	Q02575	133 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	LMAN2	Q12907	356 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	EMC10	Q5UCC4	262 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM215	Q68D42	235 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	MBLAC2	Q68D91	279 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	LONP2	Q86WA8	852 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CHP1	Q99653	195 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	FBRS	Q9HAH7	460 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	DONSON	Q9NYP3	566 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	EML5	Q05BV3	1969 aa		15.07	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	SGK1	O00141	431 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	MYO1F	O00160	1098 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	LCA5L	O95447	670 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	C7	P10643	843 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	HOXC13	P31276	330 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ETFB	P38117	255 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	MAPKAPK2	P49137	400 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF234	Q14588	700 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	STARD3	Q14849	445 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	FUT11	Q495W5	492 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ARTN	Q5T4W7	220 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf80	Q86SX3	495 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF3	Q86WH2	238 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC185	Q8N715	623 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	NUP85	Q9BW27	656 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	CIPC	Q9C0C6	399 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	FZD10	Q9ULW2	581 aa		15.06	■□□□□ 0
PTPA-222	ENST00000445241	ILVBL	A1L0T0	632 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PRPSAP2	O60256	369 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	LRCH4	O75427	683 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB2	P14652	356 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RHOQ	P17081	205 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CSK	P41240	450 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA3B	Q13214	749 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TCEAL1	Q15170	157 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RAB6C	Q53S08	254 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	FSCB	Q5H9T9	825 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	EPAS1	Q99814	870 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM245	Q9H330	911 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		15.05	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	PIEZO1	Q92508	2521 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQF6	199 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	AXIN1	O15169	862 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MTA2	O94776	668 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	CNTN5	O94779	1100 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	LRIG2	O94898	1065 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	MIP	P30301	263 aa		15.04	■□□□□ -0
PTPA-222	ENST00000445241	OR1E1	P30953	314 aa		15.04	■□□□□ -0

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