RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 ACKR2O00590 384 aa15.29■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.29■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF487B1APH4 448 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GPR25O00155 361 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3R2O00459 728 aa15.28■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 MDM4O15151 490 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA4LO95757 839 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 VDRP11473 427 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2F1P24903 491 aa15.28■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 IYDQ6PHW0 289 aa15.28■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SIX4Q9UIU6 781 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 THOP1P52888 689 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GBE1Q04446 702 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GK3PQ14409 553 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF410Q86VK4 478 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KYQ8NBH2 561 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GAB3Q8WWW8 586 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 23.1
TOP3B-206ENST00000436282 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PCNTO95613 3336 aa15.28■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ITGB3P05106 788 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DESP17661 470 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PGAM1P18669 254 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3R1P27986 724 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINB5P36952 375 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CRADDP78560 199 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PIGGQ5H8A4 983 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ERO1BQ86YB8 467 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DSELQ8IZU8 1212 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK15Q8TD08 544 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CPB2Q96IY4 423 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CNDP1Q96KN2 507 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 LACTBL1A8MY62 500 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM114B3SHH9 223 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A27O95847 323 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CAPNS1P04632 268 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PCSK6P29122 969 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC5A2P31639 672 aa15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
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