RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSPRY1Q96DX4 576 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRD8Q9H0E9 1235 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF212Q9UDV6 495 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO7AQ13402 2215 aa17.41■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFSD11O43934 449 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBL1XO60907 577 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ECI2O75521 394 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1E1P30953 314 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNAR2P48551 515 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRAK1P51617 712 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 VCPP55072 806 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMNB2Q03252 620 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf54Q08AI8 447 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDK1Q15118 436 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 AFMIDQ63HM1 303 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 TANGO2Q6ICL3 276 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFSD6LQ8IWD5 586 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPWQ8N729 165 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDI1Q8WTU0 396 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 OLFM3Q96PB7 478 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLC2Q9H0B6 622 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPHK2Q9NRA0 654 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT6Q9Y6F9 365 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 OBSL1O75147 1896 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 HACD1B0YJ81 288 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGSHP51688 502 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCHO2Q0JRZ9 810 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDGFRLQ15198 375 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARP15Q460N3 678 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF43Q68DV7 783 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF783Q6ZMS7 281 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRK7Q8WTQ7 553 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRF7Q92985 503 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00597Q9H2U6 94 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARK1Q9P0L2 795 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.4■□□□□ 0.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB8A8MWE9 144 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAMP2O60895 175 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFATC1O95644 943 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 PENKP01210 267 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGAVP06756 1048 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBP3P10745 1247 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 OXCT1P55809 520 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF33AQ06730 810 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT2Q10471 571 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 FYB2Q5VWT5 728 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 VITQ6UXI7 678 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPGS1Q6ZTW0 290 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 YAF2Q8IY57 180 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATL2Q8NHH9 583 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO2A1Q92959 643 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP2A3Q93084 1043 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT12Q99456 494 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEH1Q9H213 219 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDFIP2Q9NV92 336 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM50BQ9Y247 325 aa17.39■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa17.38■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOTCH4Q99466 2003 aa17.38■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 ILVBLA1L0T0 632 aa17.38■□□□□ 0.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms