RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PID1Q7Z2X4 250 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RELL1Q8IUW5 271 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF276Q8N554 614 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 POF1BQ8WVV4 589 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PSMG2Q969U7 264 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA13Q96N96 652 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A12Q96S37 553 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RAD54BQ9Y620 910 aa15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OBSL1O75147 1896 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 F11P03951 625 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MYZAPP0CAP1 466 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RING1Q06587 406 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB17Q13105 803 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 VEPH1Q14D04 833 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LONRF1Q17RB8 773 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CENPUQ71F23 418 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NLRP14Q86W24 1093 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GPR65Q8IYL9 337 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 USP33Q8TEY7 942 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC11Q96DB2 347 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GBF1Q92538 1859 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NCAM2O15394 837 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KLKB1P03952 638 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PSMB4P28070 264 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SLC6A4P31645 630 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NUMBP49757 651 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TXNDC8Q6A555 127 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC31Q6UY01 552 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 AGAP3Q96P47 875 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINB12Q96P63 405 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IL21Q9HBE4 155 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.76■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NDC80O14777 642 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 JCHAINP01591 159 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IRF1P10914 325 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MX2P20592 715 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SSTR1P30872 391 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IRS1P35568 1242 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GPX6P59796 221 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OLIG2Q13516 323 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CAMK1Q14012 370 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 DENND1CQ8IV53 801 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KREMEN2Q8NCW0 462 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.75■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CLUHO75153 1309 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CEP290O15078 2479 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 DRGXA6NNA5 263 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 E7ESA3 106 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GRM6O15303 877 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MAFKO60675 156 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TACR2P21452 398 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HTR7P34969 479 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ELK3P41970 407 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEA6P43360 314 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZXDBP98169 803 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms