RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 ALFQ53S48 1182 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 POTEHQ6S545 545 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DRGXA6NNA5 263 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GAS8O95995 478 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ITGAVP06756 1048 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R7Q15435 360 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP14Q86W24 1093 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 JAMLQ86YT9 394 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NUP205Q92621 2012 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 FGF13Q92913 245 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GUCD1Q96NT3 240 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 HINFPQ9BQA5 517 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 E2F8A0AVK6 867 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 SGK1O00141 431 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 PTGIRP43119 386 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 COL19A1Q14993 1142 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 OLFM3Q96PB7 478 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DONSONQ9NYP3 566 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 FAM187AA6NFU0 413 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 WASH4PA8MWX3 477 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 MTHFRP42898 656 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 XRCC4Q13426 336 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 PDK1Q15118 436 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 C5orf22Q49AR2 442 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 LZTR1Q8N653 840 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CCNYQ8ND76 341 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RIN3Q8TB24 985 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 SLCO2A1Q92959 643 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CD207Q9UJ71 328 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RAD54BQ9Y620 910 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 EYSQ5T1H1 3165 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 DFFAO00273 331 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 ZNF77Q15935 545 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ALLCQ8N6M5 410 aa22.47■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 LGMNQ99538 433 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 KLC2Q9H0B6 622 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 MX2P20592 715 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 OR1E1P30953 314 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GUCY2DQ02846 1103 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 USP4Q13107 963 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GDE1Q9NZC3 331 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 NCAM2O15394 837 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 KCNA5P22460 613 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RBL1P28749 1068 aa22.45■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 CHKAP35790 457 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 AP1B1Q10567 949 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC89Q8N998 374 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 BHMTQ93088 406 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RAB17Q9H0T7 212 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 KCNN4O15554 427 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 TBL1XO60907 577 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 CLDN11O75508 207 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXA4-201ENST00000360046 WEE1P30291 646 aa22.45■■□□□ 1.18
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