RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316843.8

LLGL1-201, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL1, Length 4,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-201ENST00000316843 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PMLP29590 882 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CTBP1Q13363 440 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SNAPC2Q13487 334 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CSHL1Q14406 222 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TBCCQ15814 346 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SIN3BO75182 1162 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CCL15Q16663 113 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 C7orf26Q96N11 449 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TSPAN1O60635 241 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 C22orf31O95567 290 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 NFKB1P19838 968 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 URGCPQ8TCY9 931 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF333Q96JL9 665 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ZFP42Q96MM3 310 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PDP2Q9P2J9 529 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PLIN3O60664 434 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 C2P06681 752 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TSPAN8P19075 237 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 L1CAMP32004 1257 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ETFBP38117 255 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 GABRB2P47870 512 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 BCO2Q9BYV7 579 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.74□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SLC18A2Q05940 514 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 WASHC5Q12768 1159 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 DDIASQ8IXT1 998 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 COG4Q9H9E3 785 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ACOT9Q9Y305 439 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PEX1O43933 1283 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 RFPL1O75677 317 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 THRAP10827 490 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PAMP19021 973 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PTPN7P35236 360 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ABL2P42684 1182 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 KRT72Q14CN4 511 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 FICDQ9BVA6 458 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 E7ESA3 106 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TIMM44O43615 452 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 GRIK1P39086 918 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 MATKP42679 507 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 TMC7Q7Z402 723 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ECSITQ9BQ95 431 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.73□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 NHSQ6T4R5 1651 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ARCQ7LC44 396 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF567Q8N184 647 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 WNT8BQ93098 351 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 COPG2Q9UBF2 871 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 SUPT7LO94864 414 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 MPSTP25325 297 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 BEX3Q00994 111 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 GAD1Q99259 594 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CPNE1Q99829 537 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 FETUBQ9UGM5 382 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 V9GYQ6 96 aa14.72□□□□□ -0.05
LLGL1-201ENST00000316843 PFDN1O60925 122 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms