RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 LZTS1Q9Y250 596 aa23.46■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 OBSL1O75147 1896 aa23.46■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 DFFAO00273 331 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 PTPN3P26045 913 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 FDFT1P37268 417 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 PPP3CCP48454 512 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 IRAK1P51617 712 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 SEMA5AQ13591 1074 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 FBXL22Q6P050 247 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ITIH5Q86UX2 942 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 NLRP14Q86W24 1093 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 TTC25Q96NG3 672 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PTX3-201ENST00000295927 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 LINC01553A4QN01 128 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 MTSS1O43312 755 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ADH1AP07327 375 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 COG7P83436 770 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 MTA1Q13330 715 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 MTM1Q13496 603 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SLC39A8Q9C0K1 460 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 C2orf78A6NCI8 922 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CSPG5O95196 566 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 RHOQP17081 205 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TPSB2P20231 275 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TPSAB1Q15661 275 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 BBS9Q3SYG4 887 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 AFMIDQ63HM1 303 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 PID1Q7Z2X4 250 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 IGSF8Q969P0 613 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SERPINB12Q96P63 405 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 RNF38Q9H0F5 515 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 IRAK3Q9Y616 596 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 E7EVH7 732 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 F5H423 210 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CNTN5O94779 1100 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 F11P03951 625 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ABHD2P08910 425 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 DNAJB1P25685 340 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ZNF33AQ06730 810 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 PARP6Q2NL67 630 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ALFQ53S48 1182 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CHSY1Q86X52 802 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 MCUQ8NE86 351 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 POF1BQ8WVV4 589 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 DPF3Q92784 378 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TSGA13Q96PP4 275 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TLDC2A0PJX2 215 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 DRGXA6NNA5 263 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 HIDE1A8MVS5 230 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ZBTB17Q13105 803 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 IL21Q9HBE4 155 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ASB3Q9Y575 518 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SMIM23A6NLE4 172 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 ACSL4O60488 711 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 AVILO75366 819 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 TACR2P21452 398 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CCNCP24863 283 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 PSMB4P28070 264 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CBLBQ13191 982 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 SPRED2Q7Z698 418 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX3-201ENST00000295927 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms