RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CMTM5Q96DZ9 223 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SNX15Q9NRS6 342 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 GINS2Q9Y248 185 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SPTLC1O15269 473 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 MMP3P08254 477 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CPA3P15088 417 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SPRP35270 261 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TAF6P49848 677 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SV2CQ496J9 727 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 RBBP8Q99708 897 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 DUSP16Q9BY84 665 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PNPOQ9NVS9 261 aa28.68■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.67■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ZNF195O14628 629 aa28.67■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PPM1JQ5JR12 505 aa28.67■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CEP41Q9BYV8 373 aa28.67■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CREB3O43889 395 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 AXLP30530 894 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 MLH1P40692 756 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PSEN1P49768 467 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 AIF1P55008 147 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A3Q00325 362 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 DGKDQ16760 1214 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PDPK2PQ6A1A2 396 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PID1Q7Z2X4 250 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 GPR142Q7Z601 462 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ECSITQ9BQ95 431 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP42A6NI28 874 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 DCLK1O15075 740 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 BTKQ06187 659 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 GRB14Q14449 540 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 IZUMO2Q6UXV1 221 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ACTRT2Q8TDY3 377 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 JADE3Q92613 823 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SLC9A7Q96T83 725 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TTC1Q99614 292 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 S100A14Q9HCY8 104 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SETD4Q9NVD3 440 aa28.66■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 M0QYT0 321 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 HUS1O60921 280 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 AP2A1O95782 977 aa28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 PRDX6P30041 224 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PEX19P40855 299 aa28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 DCLK2Q8N568 766 aa28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 WNT8BQ93098 351 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SLC2A13Q96QE2 648 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 FESP07332 822 aa28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 ITGA9Q13797 1035 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 XKR4Q5GH76 650 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 FSCBQ5H9T9 825 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PGM2L1Q6PCE3 622 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TMEM135Q86UB9 458 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 GSTCDQ8NEC7 633 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PTPN18Q99952 460 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 TSC2P49815 1807 aa28.65■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
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UBP1-201ENST00000283628 USP1O94782 785 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 BAG2O95816 211 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 NPR3P17342 541 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ARRB2P32121 409 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 CACNA2D1P54289 1103 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ATG14Q6ZNE5 492 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 BFARQ9NZS9 450 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 PDP2Q9P2J9 529 aa28.64■■■□□ 2.18
UBP1-201ENST00000283628 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.64■■■□□ 2.17
UBP1-201ENST00000283628 TMEM114B3SHH9 223 aa28.63■■■□□ 2.17
UBP1-201ENST00000283628 AHCYL1O43865 530 aa28.63■■■□□ 2.17
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