RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.81□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PCNTO95613 3336 aa9.81□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM12O43184 909 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CDH16O75309 829 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP3K6O95382 1288 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 METTL18O95568 372 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV3-27P01718 113 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MLNP12872 115 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ATF6P18850 670 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PHBP35232 272 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 NRLP54845 237 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2R2AP63151 447 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB103AP81534 67 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CREMQ03060 361 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB33AQ14088 237 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MSS51Q4VC12 460 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC38Q502W7 563 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 AFMIDQ63HM1 303 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 DPF3Q92784 378 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MYRFLQ96LU7 910 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CENPHQ9H3R5 247 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CLUHO75153 1309 aa9.8□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CENPFP49454 3210 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TET1Q8NFU7 2136 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TLDC2A0PJX2 215 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 DRGXA6NNA5 263 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF103O00237 685 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SOAT2O75908 522 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 APOEP02649 317 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 APRTP07741 180 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CSH1P0DML2 217 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CSH2P0DML3 217 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOQP17081 205 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPN3P26045 913 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1D2P34982 312 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MMP13P45452 471 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP3CCP48454 512 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 LMAN1P49257 510 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBP50607 506 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 LBX1P52954 281 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GPX6P59796 221 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GAD2Q05329 585 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 AP1B1Q10567 949 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 NR1H3Q13133 447 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 BBS9Q3SYG4 887 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RASIP1Q5U651 963 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CYS1Q717R9 158 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 NPWQ8N729 165 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNYQ8ND76 341 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FATE1Q969F0 183 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.79□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms