RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PGAM1	P18669	254 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ADRA1B	P35368	520 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CLCNKB	P51801	687 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152		B2RBV5	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MLN	P12872	115 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GLUD2	P49448	558 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TPI1	P60174	286 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TAF11	Q15544	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TLE6	Q9H808	572 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ATP9B	O43861	1147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TYK2	P29597	1187 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SATB1	Q01826	763 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DPYS	Q14117	519 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NPW	Q8N729	165 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SMO	Q99835	787 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DCLK1	O15075	740 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GSR	P00390	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	POLB	P06746	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GNAZ	P19086	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CPT1A	P50416	773 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	APBB2	Q92870	758 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MKS1	Q9NXB0	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	IL1B	P01584	269 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TPH1	P17752	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	YY1	P25490	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN3	P26045	913 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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