RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf29Q8N999 325 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MDM4O15151 490 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP26A1O43174 497 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GZMAP12544 262 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP3P21580 790 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NDST1P52848 882 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GNG11P61952 73 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PROSER1Q86XN7 944 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 UBR7Q8N806 425 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SCML2Q9UQR0 700 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH10P35580 1976 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPAP45381 313 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC14A1Q13336 389 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TWNKQ96RR1 684 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NACA2Q9H009 215 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 RCCD1A6NED2 376 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GFRA2O00451 464 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SYPP08247 313 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 MAOBP27338 520 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB2AQ13885 445 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC39CQ8N584 583 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CBFA2T3O75081 653 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 KLKB1P03952 638 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP11B1P15538 503 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKGP49619 791 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CDR2Q01850 454 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIK2Q13002 908 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ENPP2Q13822 863 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG6Q3KR16 790 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 DNASE2BQ8WZ79 361 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PLK2Q9NYY3 685 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAI1Q9UI46 699 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF10Q6WRI0 2623 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS20P59510 1910 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0U1RQJ8 604 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQH9 124 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 P4HA1P13674 534 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CASQ1P31415 396 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 BNC1Q01954 994 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT11Q495W5 492 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SCD5Q86SK9 330 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC93AQ86WB7 457 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 BHMTQ93088 406 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ISCUQ9H1K1 167 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 APC2O95996 2303 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 STC2O76061 302 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFZP0C0S5 128 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FTH1P19P0C7X4 201 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 USP8P40818 1118 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF132P52740 706 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAPQ12770 1279 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL1Q15170 157 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FYB2Q5VWT5 728 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SDE2Q6IQ49 451 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFVQ71UI9 128 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 NAXDQ8IW45 347 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GPSM3Q9Y4H4 160 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 RARGP13631 454 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 ADORA2BP29275 332 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-216ENST00000628306 CD6P30203 668 aa25.08■■□□□ 1.61
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