RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 HSD17B4P51659 736 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PRAMEP78395 509 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 FLOT2Q14254 428 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TEX44Q53QW1 395 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM198Q66K66 360 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DNERQ8NFT8 737 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ZBTB14O43829 449 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CYP2C8P10632 490 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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NEDD9-216ENST00000620854 ARPP19P56211 112 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 FSTL1Q12841 308 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 LAMC2Q13753 1193 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DLG2Q15700 870 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CA9Q16790 459 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 MAVSQ7Z434 540 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 SNX32Q86XE0 403 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 C12orf29Q8N999 325 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TWNKQ96RR1 684 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 SERPINI1Q99574 410 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 COG4Q9H9E3 785 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 USP29Q9HBJ7 922 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL2O95198 593 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TFPTP0C1Z6 253 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RALBP11234 206 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GLRBP48167 497 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 HDAC4P56524 1084 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GBE1Q04446 702 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 KCNJ11Q14654 390 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 KIF19Q2TAC6 998 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.13□□□□□ -1.27
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NEDD9-216ENST00000620854 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PLD5Q8N7P1 536 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.13□□□□□ -1.27
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NEDD9-216ENST00000620854 OR52B2Q96RD2 323 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CGRRF1Q99675 332 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RSAD1Q9HA92 442 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJA2O60884 412 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 CRTAMO95727 393 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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NEDD9-216ENST00000620854 COX4I1P13073 169 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ADORA2BP29275 332 aa7.12□□□□□ -1.27
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NEDD9-216ENST00000620854 ETFBP38117 255 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 RGS2P41220 211 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 FCGRTP55899 365 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 WASHC5Q12768 1159 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PID1Q7Z2X4 250 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 MAPK15Q8TD08 544 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 GPAMQ9HCL2 828 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 STRNO43815 780 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 HBP1O60381 514 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 TMCC1O94876 653 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD9-216ENST00000620854 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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