RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HOXC13P31276 330 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSEN1P49768 467 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PARP6Q2NL67 630 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP41Q3LFD5 358 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLIC5Q9NZA1 410 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CDY1Q9Y6F8 540 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GARSP41250 739 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC39A13Q96H72 371 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP41Q9BYV8 373 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGSF9Q9P2J2 1179 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTRRQ9UBK8 725 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COL4A6Q14031 1691 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTSS1O43312 755 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC2A3P11169 496 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SARNPP82979 210 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DUSP4Q13115 394 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKLE1Q8NAG6 615 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGSF21Q96ID5 467 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXO6A8MYZ6 492 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNK1O00180 336 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CREB1P16220 341 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPN3P26045 913 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TAF10Q12962 218 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC8B1Q6J4K2 584 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DHRS4Q9BTZ2 278 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VN1R3Q9BXE9 311 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GREB1Q4ZG55 1949 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RASA4BC9J798 803 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RASA4O43374 803 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMB4P28070 264 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMD5Q16401 504 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARTNQ5T4W7 220 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PID1Q7Z2X4 250 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYTH2Q99418 400 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RABEP2Q9H5N1 569 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LTBP2Q14767 1821 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM120BA0PK00 339 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WDR27A2RRH5 827 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MLNP12872 115 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRAFP15056 766 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SEC24CP53992 1094 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TBX4P57082 545 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRABD2AQ86V40 505 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TOP1MTQ969P6 601 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIGLEC10Q96LC7 697 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C1orf74Q96LT6 269 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PAFAH2Q99487 392 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HS3ST4Q9Y661 456 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 F5H423 210 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADAM12O43184 909 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COG7P83436 770 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF33AQ06730 810 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EFEMP1Q12805 493 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP36Q96G28 342 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CPP00450 1065 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GSTA2P09210 222 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STX2P32856 288 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRIA1P42261 906 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRC26Q2I0M4 334 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RASIP1Q5U651 963 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP14Q86W24 1093 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LZTR1Q8N653 840 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VAT1Q99536 393 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SENP1Q9P0U3 644 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GMNCA6NCL1 334 aa27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms