RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564584.1

CTU2-205, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 896 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-205ENST00000564584 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 EDEM1Q92611 657 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 OTUB2Q96DC9 234 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 EDEM2Q9BV94 578 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DCLK3Q9C098 648 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 THAP2Q9H0W7 228 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SGK1O00141 431 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 GRAP2O75791 330 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 FYNP06241 537 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 GPD1P21695 349 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 BCKDHBP21953 392 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PGFP49763 221 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RING1Q06587 406 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TCEAL1Q15170 157 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TAF5Q15542 800 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KIAA1328Q86T90 577 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PLD4Q96BZ4 506 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SLC12A8A0AV02 714 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 LNP1A1A4G5 178 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MAP3K13O43283 966 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TBX18O95935 607 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 VAV2P52735 878 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SHC2P98077 582 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KDSRQ06136 332 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 STRADAQ7RTN6 431 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MIB1Q86YT6 1006 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NAT16Q8N8M0 369 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RFFLQ8WZ73 363 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NT5C3BQ969T7 300 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 COL26A1Q96A83 441 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MCEEQ96PE7 176 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NPY6RQ99463 290 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CNPY3Q9BT09 278 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 NUP85Q9BW27 656 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 FAM170AA1A519 330 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MYO1FO00160 1098 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 IRAK2O43187 625 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ADAM23O75077 832 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 RNF8O76064 485 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 MTA2O94776 668 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 LATS1O95835 1130 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 IGLV3-25P01717 112 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 APOEP02649 317 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CCDC175P0C221 793 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 FLT3P36888 993 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 P2RY2P41231 377 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 ARHGAP25P42331 645 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 SULT1E1P49888 294 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 TBX4P57082 545 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 IRX4P78413 519 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CCZ1BP86790 482 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-205ENST00000564584 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms