RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TYK2	P29597	1187 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP8	P85298	464 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DPYS	Q14117	519 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC153	Q494R4	210 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf46	Q6P387	395 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RFX8	Q6ZV50	586 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF567	Q8N184	647 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	WNT8B	Q93098	351 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CERS2	Q96G23	380 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SYBU	Q9NX95	663 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		18.89	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559		M0QYT0	321 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CREB3	O43889	395 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PROC	P04070	461 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GJA5	P36382	358 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR3	P61158	418 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PCLAF	Q15004	111 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NRG4	Q8WWG1	115 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	EBF4	Q9BQW3	602 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	THTPA	Q9BU02	230 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	COPG2	Q9UBF2	871 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GJD2	Q9UKL4	321 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559		F5H423	210 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2C9	P11712	490 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA4	P22459	653 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	AP2B1	P63010	937 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DEUP1	Q05D60	604 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PID1	Q7Z2X4	250 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ISL2	Q96A47	359 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GPAM	Q9HCL2	828 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PSAT1	Q9Y617	370 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PDHX	O00330	501 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MTSS1	O43312	755 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ITM2A	O43736	263 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LILRA4	P59901	499 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO27	Q8NI29	283 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FAM136A	Q96C01	138 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MAML3	Q96JK9	1138 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TINF2	Q9BSI4	451 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	VCX	Q9H320	206 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	BFAR	Q9NZS9	450 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	KLK14	Q9P0G3	267 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DCLK1	O15075	740 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO21	O94952	628 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RALB	P11234	206 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB8	P50452	374 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB3	Q13509	450 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF778	Q96MU6	729 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB16	A2A368	324 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	AP2A1	O95782	977 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	F2	P00734	622 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PDHA1	P08559	390 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-10	P10266	1014 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ADRA1B	P35368	520 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA12	P43365	314 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	HCAR3	P49019	387 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NME3	Q13232	169 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	HIC1	Q14526	733 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61

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