RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TWNK	Q96RR1	684 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EYA3	Q99504	573 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SIK2	Q9H0K1	926 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNC	Q9H7C4	482 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMT1	Q9H993	441 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	STK32B	Q9NY57	414 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RGL1	Q9NZL6	768 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HESX1	Q9UBX0	185 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CA14	Q9ULX7	337 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX20	Q9UMR3	447 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF711	Q9Y462	761 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QYG6	137 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CPLX1	O14810	134 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN3	O60637	253 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPH3	O95157	252 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CSPG5	O95196	566 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA4L	O95757	839 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHD	P01880	384 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAI2	P04899	355 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCB	P05771	671 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KIT	P10721	976 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMP2	P13473	410 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	STMN1	P16949	149 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5D	P30049	168 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPA	P38571	399 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MSH2	P43246	934 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF131	P52739	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SP2	Q02086	613 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EPS8	Q12929	822 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FHL3	Q13643	280 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3A	Q14563	771 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	WTAP	Q15007	396 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DLGAP5	Q15398	846 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD6	Q17RP2	521 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF2	Q5BJF6	829 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NRAC	Q8N912	160 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	STYX	Q8WUJ0	223 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D5	Q92609	795 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	WBP1	Q96G27	269 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX27	Q96L92	541 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92

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