RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CPXM1Q96SM3 734 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.8□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 MBLAC2Q68D91 279 aa5.79□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A13Q96H72 371 aa5.79□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC3BQ9H195 1237 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC32A1Q9H598 525 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.79□□□□□ -1.48
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