RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RGS5O15539 181 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LRRN2O75325 713 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DRD4P21917 467 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 COPAP53621 1224 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ABATP80404 500 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PPP3CAQ08209 521 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TTLL4Q14679 1199 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EMC10Q5UCC4 262 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ALLCQ8N6M5 410 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SNX31Q8N9S9 440 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KLC2Q9H0B6 622 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MEI4A8MW99 385 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 BTN3A3O00478 584 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HBP1O60381 514 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 IFI30P13284 250 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TPTEP56180 551 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NAB1Q13506 487 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZACNQ401N2 412 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CYP4X1Q8N118 509 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 AADATQ8N5Z0 425 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 WNK4Q96J92 1243 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GPR88Q9GZN0 384 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 VTA1Q9NP79 307 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM64BA6NI03 449 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CENPXA8MT69 81 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PIK3R2O00459 728 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PSTPIP1O43586 416 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RAD23AP54725 363 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PHC1P78364 1004 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ANO7Q6IWH7 933 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRD-214ENST00000540109 SLCO2A1Q92959 643 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PADI4Q9UM07 663 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD3O43242 534 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ADRB2P07550 413 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ALADP13716 330 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MYL6P60660 151 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 VGLL4Q14135 290 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SOX13Q9UN79 622 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRD-214ENST00000540109 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FYNP06241 537 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HSMCR30P0CW71 290 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CYP11B1P15538 503 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MAGP20916 626 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CD151P48509 253 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HPCAP84074 193 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SNAPC2Q13487 334 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MTERF2Q49AM1 385 aa6.19□□□□□ -1.42
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