RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CACHD1Q5VU97 1274 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LIPMQ5VYY2 423 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM160B1Q5W0V3 765 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GRHL2Q6ISB3 625 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM166AQ6J272 317 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM71Q6P5X7 295 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF790Q6PG37 636 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 BHLHB9Q6PI77 547 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTHFD1LQ6UB35 978 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CEACAM20Q6UY09 585 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MON1BQ7L1V2 547 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCNK18Q7Z418 384 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRRTM1Q86UE6 522 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RTN4RL2Q86UN3 420 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SATL1Q86VE3 508 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCNMB4Q86W47 210 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RASSF3Q86WH2 238 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PPP1R3BQ86XI6 285 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PALB2Q86YC2 1186 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PDSS2Q86YH6 399 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TICAM1Q8IUC6 712 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DDIASQ8IXT1 998 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZBED8Q8IZ13 594 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DSELQ8IZU8 1212 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ABCA7Q8IZY2 2146 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SPARTQ8N0X7 666 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MPP5Q8N3R9 675 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 METTL25Q8N6Q8 603 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM217Q8N7C4 229 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EFHBQ8N7U6 833 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RNF152Q8N8N0 203 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 BMPERQ8N8U9 685 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRRC57Q8N9N7 239 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF114Q8NC26 417 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 C3orf20Q8ND61 904 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DDHD1Q8NEL9 900 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC24A4Q8NFF2 622 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR10V1Q8NGI7 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FGFBP3Q8TAT2 258 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 BPIFB1Q8TDL5 484 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 BCAS4Q8TDM0 211 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LMBR1Q8WVP7 490 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RSAD2Q8WXG1 361 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC5A5Q92911 643 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SCAMP4Q969E2 229 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RFT1Q96AA3 541 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LGALS12Q96DT0 336 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTBPQ96DY7 904 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 BICD1Q96G01 975 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZDHHC12Q96GR4 267 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HES6Q96HZ4 224 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RAX2Q96IS3 184 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TXNDC15Q96J42 360 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HIC2Q96JB3 615 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FEM1CQ96JP0 617 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MRGPRX4Q96LA9 322 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TTC14Q96N46 770 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FOXN4Q96NZ1 517 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGAP3Q96P47 875 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPR78Q96P69 363 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SENP7Q9BQF6 1050 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PIGQQ9BRB3 760 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HTATIP2Q9BUP3 242 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TTLL2Q9BWV7 592 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCSER2Q9H7U1 834 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AS3MTQ9HBK9 375 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EMC7Q9NPA0 242 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 VPS45Q9NRW7 570 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ASNSD1Q9NWL6 643 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRFN1Q9P244 771 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 THEGQ9P2T0 379 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GABBR1Q9UBS5 961 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRWD1Q9UFC0 647 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ABCF2Q9UG63 623 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CPA4Q9UI42 421 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SCOCQ9UIL1 159 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms