RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATPAF2Q8N5M1 289 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTP4Q96DX8 246 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC77Q9BR77 488 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATXN3LQ9H3M9 355 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WASH4PA8MWX3 477 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AP3B1O00203 1094 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMD3O43242 534 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COCHO43405 550 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBX18O95935 607 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CKMP06732 381 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYL4P12829 197 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCNCP24863 283 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBL1P28749 1068 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HOXC13P31276 330 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ETFBP38117 255 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPKAPK2P49137 400 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLCN4P51793 760 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PMS2P54278 862 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARL4CP56559 192 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GALNT2Q10471 571 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MS4A13Q5J8X5 152 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DENND2CQ68D51 928 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC25Q86WR0 208 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC13Q8IYE1 715 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDIK1LQ8N165 341 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BBS5Q8N3I7 341 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBXO25Q8TCJ0 367 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HDAC11Q96DB2 347 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTC25Q96NG3 672 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OLFM3Q96PB7 478 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CORO1BQ9BR76 489 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FUT8Q9BYC5 575 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TLE6Q9H808 572 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIDD1Q9HB75 910 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAN1C1Q9NR34 630 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRHL1Q9NZI5 618 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEPT10Q9P0V9 454 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VANGL2Q9ULK5 521 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BRCA2P51587 3418 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0A0MRY4 1105 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIDE1A8MVS5 230 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM72CH0Y354 149 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DFFAO00273 331 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRM6O15303 877 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHADO15335 359 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MFSD11O43934 449 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OAS1P00973 400 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F11P03951 625 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POU2F2P09086 479 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TACR2P21452 398 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL22P35268 128 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AVPR1AP37288 418 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GARSP41250 739 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PGFP49763 221 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDK16Q00536 496 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PARP15Q460N3 678 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADGRF1Q5T601 910 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM72AQ5TYM5 149 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAP1GAP2Q684P5 730 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM72DQ6L9T8 149 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM72BQ86X60 149 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EXOC4Q96A65 974 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA13Q96N96 652 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRDM12Q9H4Q4 367 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MED4Q9NPJ6 270 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAB6BQ9NRW1 208 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HPCAL4Q9UM19 191 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa12.56□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.55□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DRGXA6NNA5 263 aa12.55□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF103O00237 685 aa12.55□□□□□ -0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP2K7O14733 419 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms