RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACACB	O00763	2458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A087WZ62	844 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	TLR5	O60602	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	TPH1	P17752	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADORA2A	P29274	412 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDE6C	P51160	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCNI	Q14094	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	RFK	Q969G6	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRANK1	O15050	2925 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNQ3	O43525	872 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	RGS10	O43665	173 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIAS2	O75928	621 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	RASAL1	O95294	804 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHRM2	P08172	466 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	CETP	P11597	493 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYL4	P12829	197 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABCB4	P21439	1286 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSPA7	P48741	367 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	BCAT1	P54687	386 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	DMWD	Q09019	674 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TBCC	Q15814	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	BAD	Q92934	168 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	PBK	Q96KB5	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	EYA3	Q99504	573 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TOPBP1-208	ENST00000511439	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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