RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 BBS2Q9BXC9 721 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GPR88Q9GZN0 384 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CHST7Q9NS84 486 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PYGLP06737 847 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 IRX4P78413 519 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PTP4A2Q12974 167 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PARP6Q2NL67 630 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TTC17Q96AE7 1141 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SDCBP2Q9H190 292 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0A0MRY4 1105 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CHEK2O96017 543 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 AGTP01019 485 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CDK16Q00536 496 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ALG3Q92685 438 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 EXT2Q93063 718 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA13Q96N96 652 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MIOSQ9NXC5 875 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 COG5Q9UP83 839 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 LIASO43766 372 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 XRCC4Q13426 336 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MPPE1Q53F39 396 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FAM26DQ5JW98 314 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TAC4Q86UU9 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC6Q86X45 466 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PLD4Q96BZ4 506 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC19Q9H756 370 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SUN1O94901 812 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 L1CAMP32004 1257 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NUMBP49757 651 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MMRN1Q13201 1228 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC6Q16204 474 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRD-211ENST00000486161 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 POF1BQ8WVV4 589 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SUSD6Q92537 303 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 APOL2Q9BQE5 337 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CEP41Q9BYV8 373 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 UBP1Q9NZI7 540 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 WDR91A4D1P6 747 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ITGAVP06756 1048 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 BCL2L1Q07817 233 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MTMR11A4FU01 709 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ACSL4O60488 711 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SOAT2O75908 522 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NPY2RP49146 381 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TMPRSS15P98073 1019 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SLC29A2Q14542 456 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TAF5Q15542 800 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 AADACL2Q6P093 401 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ERAP2Q6P179 960 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 WDR70Q9NW82 654 aa8.47□□□□□ -1.05
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