RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 USP41Q3LFD5 358 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RASIP1Q5U651 963 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 IGSF21Q96ID5 467 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MTRRQ9UBK8 725 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 FETUBQ9UGM5 382 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 LTBP2Q14767 1821 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MX2P20592 715 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RASA2Q15283 850 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PARP6Q2NL67 630 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 C14orf80Q86SX3 495 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MPP5Q8N3R9 675 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 GIPC2Q8TF65 315 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 CFAP36Q96G28 342 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PPCSQ9HAB8 311 aa22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TMEM120BA0PK00 339 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 BRAFP15056 766 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ATF6P18850 670 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 EFEMP1Q12805 493 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MPP2Q14168 576 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TRABD2AQ86V40 505 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TOP1MTQ969P6 601 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RASA4BC9J798 803 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RASA4O43374 803 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 OR1D2P34982 312 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 RFC2P35250 354 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TBX4P57082 545 aa22.34■■□□□ 1.17
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USP13-202ENST00000482333 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PID1Q7Z2X4 250 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 DPF3Q92784 378 aa22.34■■□□□ 1.17
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USP13-202ENST00000482333 C2CD2LO14523 706 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 HTR7P34969 479 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 GJA8P48165 433 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 DEFB103AP81534 67 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 CDK16Q00536 496 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ZBTB17Q13105 803 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 NLRP14Q86W24 1093 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 LRRC39Q96DD0 335 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.34■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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USP13-202ENST00000482333 C1QAP02745 245 aa22.33■■□□□ 1.17
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USP13-202ENST00000482333 NR1H3Q13133 447 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ARMC5Q96C12 935 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 CYTH2Q99418 400 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.33■■□□□ 1.17
USP13-202ENST00000482333 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.32■■□□□ 1.16
USP13-202ENST00000482333 GMNCA6NCL1 334 aa22.32■■□□□ 1.16
USP13-202ENST00000482333 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.32■■□□□ 1.16
USP13-202ENST00000482333 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP13-202ENST00000482333 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP13-202ENST00000482333 CPP00450 1065 aa22.32■■□□□ 1.16
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