RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PLK4	O00444	970 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CD27	P26842	260 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SLC6A4	P31645	630 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GRK6	P43250	576 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SLC11A2	P49281	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PNOC	Q13519	176 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SGK2	Q9HBY8	427 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	STIM2	Q9P246	746 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054		H0Y8X5	98 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IRAK2	O43187	625 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TNFSF14	O43557	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ACSL4	O60488	711 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CCT8	P50990	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IL9R	Q01113	521 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	DHRS13	Q6UX07	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GANC	Q8TET4	914 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	MYO19	Q96H55	970 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TSG101	Q99816	390 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054		M0QYV0	167 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SIN3B	O75182	1162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CALCA	P01258	141 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	LTF	P02788	710 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PAEP	P09466	180 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CSK	P41240	450 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	CTSK	P43235	329 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TBX4	P57082	545 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SEMG2	Q02383	582 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	KAT5	Q92993	513 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	MID1	O15344	667 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTSL-205	ENST00000482054	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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